Федеральное бюджетное учреждение Башкирская лаборатория судебной экспертизы Министерства юстиции Российской Федерации (далее по тексту — Лаборатория) в своей деятельности руководствуется Конституцией Российской Федерации, Федеральным законом от 31.05.2001 № 73-ФЗ «О государственной судебно-экспертной деятельности в Российской Федерации», процессуальным законодательством, иными федеральными законами и нормативными правовыми актами Российской Федерации.

Экспертами Лаборатории являются аттестованные сотрудники, производящие судебную экспертизу в порядке исполнения своих должностных обязанностей, имеющие высшее профессиональное образование, прошедшие специальную подготовку, которым в порядке, установленном нормативными правовыми актами Министерства юстиции Российской Федерации, присвоено право самостоятельного производства экспертиз по конкретной экспертной специальности. Аттестация на право самостоятельного производства судебной экспертизы осуществляется экспертно-квалификационными комиссиями.

Лаборатория проводит независымые экспертизы по уголовным делам и в рамках исполнения статей 144 и 145 Уголовного процессуального кодекса Российской Федерации Лаборатория выполняет экспертизы на безвозмездной основе, а по гражданским и арбитражным делам, делам об административных правонарушениях, а также по заявлениям юридических и физических лиц — на возмездной основе.

Научно-методическое обеспечение осуществляет ФБУ Российский федеральный центр судебной экспертизы при Министерстве юстиции Российской Федерации. 

Установленной территориальной сферой экспертного обслуживания Лаборатории являются г. Уфа и Республика Башкортостан.